Le gameplay de Monster Hunter Stories se rapprochera davantage d'un RPG type Pokémon , le jeu utilisera donc un type de combat tour par tour. Dans le jeu ,on incarnera au choix un personnage masculin ou féminin dont son histoire débutera dans le Village Rider où le héros a fait ses armes pour devenir un Rider aux côtés de son familier et mascotte du jeu Nabiru. Il devra ensuite mener son aventure en parcourant le monde après s'être vu remettre la Pierre de Kizuna.